Najbardziej wyrafinowaną alternatywną teorią jest prawdopodobnie teoria Florentino Ameghino, który postulował autochtoniczną ewolucję gatunków w oparciu o antropologię szkieletu i wykopaliska zgodnie z poniższą tabelą:
Niemieccy antropolodzy, z Hermannem Burmeisterem na czele, sprzeciwili się tej teorii. Burmeister zaproponował katastroficzną teorię ewolucji człowieka, podobną do teorii Cuviera. Zgodnie z tymi ideami ludzie ewoluowali nie stopniowo, ale bardzo szybko i niezależnie. William Henry Holmes aktywnie kwestionował, że istniały dowody na to, że ludzie byli w Ameryce przed ostatnim zlodowaceniem, a zatem musieli pochodzić skądinąd. Franz Boas kwestionował to i argumentował, że człowiek przybył w okresie międzylodowcowym. Podobnie Daniel Garrison Brinton argumentował, że Amerykanin musiał przybyć w okresie zlodowacenia, a ponieważ Syberia była wówczas uważana za niezamieszkaną, nie mogli mieć syberyjskiego pochodzenia, ale musieli być Polinezyjczykiem lub inną azjatycką emigracją. Brinton argumentował również, że Eskimosi są całkowicie różni od Syberyjczyków, ale zajmują całe koło podbiegunowe, więc oni i inni im podobni Amerykanie musieli mieć niezależne, niesyberyjskie pochodzenie. Kwestionował również, że idea, że Ameryka została odcięta, ponieważ Eskimosi opływają bez potrzeby mostu lądowego.
Przed powstaniem tych teorii istniała duża szkoła myślenia, która uważała Amerykanów za autochtonicznych. Do tych teoretyków należeli: Levegue, Humboldt, McCullogh, Morton i Quatrefages. Większość z tych pomysłów proponowała tylko częściowo autochtonię i zawierała elementy katastroficzne lub ewolucyjne. Kilku teoretyków, takich jak Kaimes, Morton, Nott i Glidden, popierało w pełni autochtoniczne pochodzenie bez składnika starego świata. Zauważ, że wiele starych teorii obejmowało podróże lądowe, więc pomysł, że „most lądowy” jest nowoczesnym pomysłem, jest nieco niepoprawny. Temat, który rdzenni Amerykanie wywodzili się z jakiegoś rodzaju Syberyjczyków lub Mongołów, był powszechny bardzo wcześnie.
Na marginesie, „teorie”, że Hindusi wywodzili się od Izraelitów, Fenicjan lub im podobnych, były tylko fantazjami „historyków” piszących dla publiczności i nie były uważane za poważną naukę przez prawdziwych antropologów. Wymieniłem powyżej głównych myślicieli naukowych z okresu przednowoczesnego, których uważano za poważnych naukowców.